脑干具有复杂的解剖生理功能，脑干病变所引起的临床症状及体征复杂、多样，其轻重程度悬殊很大，并与病变的性质有一定关系。分别以脑干 “经典”、“一般”和“特定” 的症状体征论述。
1、脑干的“经典”症状及体征有：①颅神经及其核性损伤的症状。②交叉性麻痹。③共济失调。
颅神经损伤有定位意义，尤其神经核性的损伤更说明病变在脑干内。如解剖中论述，第Ⅲ和Ⅳ颅神经发源于中脑，其中滑车神经的功能在日常生活不如其它的重要，故患者主诉中，眼上斜肌的麻痹几乎得不到描述。第Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ颅神经与脑桥有关，第Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ和Ⅻ颅神经出入延髓。咽反射减弱，吞咽困难等第Ⅸ、Ⅹ颅神经损伤本为延髓症状，但脑桥病变中也常见，这与监控吞咽运动程序的脑桥中枢损伤有关。
交叉性麻痹或称交叉性瘫痪为脑干特有症状，指麻痹颅神经的对侧肢体运动功能障碍。交叉性感觉障碍也为其中一种。由于脑干肿瘤起源于被盖部居多，锥体束位于腹侧部，所以在脑干肿瘤患者中，早期的交叉性麻痹症状不如脑干血管性病变中多见。
共济失调的发生与解剖基础有关，中脑、脑桥及延髓以上，中，下三对脑脚与小脑相连；且小脑和脑桥同是胚胎的后脑演变来的。临床上，脑干三部分的病变均可引起共济失调，并且多为早期症状。
2、脑干的一般症状：非脑干病变特有，包括高颅压，感觉及运动功能障碍等。
高颅压：中脑肿瘤患者产生高颅压症状的约占65%，脑桥不到10%，延髓25%左右。
感觉功能障碍：是一种主观症状，目前尚无客观评价标准。临床上的表现形式较零乱，交叉性感觉障碍可在部分病例中出现。
运动功能障碍：中脑肿瘤若累及大脑脚，对侧肢体瘫痪表现较完全；在脑桥，即使肿瘤位于腹侧，一些患者还保持有相当的运动功能，这与锥体束在脑桥分为若干小束有关。延髓及延颈交界区肿瘤可以引起多样化的肢体活动障碍，可表现为半身瘫痪，一肢瘫痪，双下肢截瘫，四肢活动障碍，甚至表现为节段性麻痹。
3、脑干的特定症状及体征：这些症状及体征有其解剖学基础，虽然有些症状不多见，但其一经出现，有定位意义，有些尚未被人们充分认识。如中脑肿瘤引起的发作性意识障碍、红核震颤；脑桥背侧侧视中枢病变导致的同侧注视麻痹；脑桥腹侧受累的病理性发笑；及脑桥被盖背外侧区病损后的排尿障碍；延髓病变造成的呼吸困难、顽固性呃逆、胃肠出血及心跳改变等等。
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